Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

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Length 1,954 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD5Q8TDI0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CHD5Q8TDI0 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHD5Q8TDI0 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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