Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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KLHDC9Q8NEP7 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KLHDC9Q8NEP7 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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