Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PBRM1Q86U86 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PBRM1Q86U86 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms