Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
PPP1R1AQ13522 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PPP1R1AQ13522 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms