Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRJQ12913 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRJQ12913 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRJQ12913 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PTPRJQ12913 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRJQ12913 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.8 ms