Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
DEFA6Q01524 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms