Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NESP48681 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NESP48681 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NESP48681 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NESP48681 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NESP48681 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms