Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFNP31947 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFNP31947 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFNP31947 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFNP31947 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFNP31947 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms