Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRDP23468 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRDP23468 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRDP23468 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRDP23468 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRDP23468 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRDP23468 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
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PTPRDP23468 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.05■□□□□ 0
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PTPRDP23468 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRDP23468 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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PTPRDP23468 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRDP23468 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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PTPRDP23468 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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PTPRDP23468 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRDP23468 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRDP23468 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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