Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CA4P22748 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CA4P22748 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CA4P22748 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms