Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CFTRP13569 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFTRP13569 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CFTRP13569 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFTRP13569 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms