Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM10L2BP0DMW5 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms