Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VTNP04004 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VTNP04004 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VTNP04004 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VTNP04004 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VTNP04004 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VTNP04004 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VTNP04004 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VTNP04004 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VTNP04004 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VTNP04004 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VTNP04004 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VTNP04004 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VTNP04004 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VTNP04004 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms