Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F8A0AVK6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F8A0AVK6 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms