Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
L1RE1Q9UN81 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms