Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms