Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIRIP3Q9BW71 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIRIP3Q9BW71 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms