Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
GIPC3Q8TF64 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms