Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDKL3Q8IVW4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDKL3Q8IVW4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms