Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PRRT2Q7Z6L0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms