Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PKDCCQ504Y2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PKDCCQ504Y2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms