Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PCDHGA6-201ENST00000517434 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LOXHD1-210ENST00000536736 6848 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LINC00869-206ENST00000610578 5734 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
USF2Q15853 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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