Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC5A11-201ENST00000347898 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 TMEM63B-201ENST00000259746 3318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NLRP1-201ENST00000262467 5131 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 PLEKHG5-202ENST00000377725 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VAMP3Q15836 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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