Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CKAP5Q14008 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CKAP5Q14008 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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