Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ABCE1P61221 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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