Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UBASH3AP57075 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms