Protein–RNA interactions for Protein: P55107

GDF10, Growth/differentiation factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF10P55107 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GDF10P55107 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GDF10P55107 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms