Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DNA2P51530 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DNA2P51530 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DNA2P51530 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms