Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TAF6P49848 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF6P49848 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF6P49848 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TAF6P49848 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TAF6P49848 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TAF6P49848 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120 ms