Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC1A1P43005 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms