Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PTPRMP28827 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PTPRMP28827 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRMP28827 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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