Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
L1RE1Q9UN81 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms