Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DBF4Q9UBU7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DBF4Q9UBU7 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms