Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP1-5Q9BYS1 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms