Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms