Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ZNF548Q8NEK5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF548Q8NEK5 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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