Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNTROBQ8N137 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms