Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FBXO38Q6PIJ6 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FBXO38Q6PIJ6 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms