Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NCF4Q15080 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NCF4Q15080 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NCF4Q15080 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NCF4Q15080 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NCF4Q15080 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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NCF4Q15080 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NCF4Q15080 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NCF4Q15080 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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