Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HTR4Q13639 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HTR4Q13639 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HTR4Q13639 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HTR4Q13639 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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