Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE3BQ13370 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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