Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFCP2Q12800 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFCP2Q12800 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms