Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSC1Q08554 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms