Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BEX3Q00994 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms