Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 BX324167.2-201ENST00000623717 3316 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
LINC00313P59037 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms