Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPHB4P54760 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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