Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GABRB2P47870 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms