Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SIN3BO75182 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SIN3BO75182 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms