Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPS2Q9BXY5 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms