Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMARCE1Q969G3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMARCE1Q969G3 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms